行番号とアクセッションIDを混同する結合バグを特定して修正。
Identified and corrected a join bug that confused row numbers with accession IDs.
01
主なポイント Highlights
一対一結合で実在IDを全工程に保持し、サンプル追跡性を回復。
Restored sample traceability by preserving real IDs through one-to-one joins.
内部指標、再標本化安定性、生物学的ラベル整合性を分けてクラスタを検証。
Validated clusters separately by internal indices, resampling stability, and biological-label agreement.
02
研究の流れ Research Flow
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課題Problem
ID不整合を修復し、イネ多様性の低次元構造と群分けを過大解釈せず再評価する。
Repair identifier integrity and reassess low-dimensional structure and grouping in rice diversity without overclaiming.
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方法Method
頑健回帰、PCA、複数クラスタ法を、ID保持パイプライン上で実行する。
Run robust regression, PCA, and multiple clustering methods in an ID-preserving pipeline.
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検証Validation
ブートストラップ安定性、内部指標、既知ラベルとの対応を独立に確認する。
Assess bootstrap stability, internal indices, and alignment with known labels independently.
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成果Outcome
追跡可能な解析へ修復し、クラスタを真の分類ではなく探索的構造として報告。
Restored a traceable analysis and reported clusters as exploratory structure rather than ground-truth classes.
03
限界と適用範囲 Limitations & Scope
原データはCC BY-NC-ND 3.0条件で、ローカルの正規化データと派生数値を再配布できない。
The source is under CC BY-NC-ND 3.0 terms, so local normalized data and derived numeric results are not redistributed.
04
公開範囲 Publication Boundary
公開ケーススタディPublic case study
公開ページは方法と修復内容の要約のみ。非営利・改変禁止を含むライセンス境界のため、データ、実ID、コード、図、派生数値は公開しない。
The public page contains only a method and repair summary. Because the license includes noncommercial and no-derivatives restrictions, data, real IDs, code, figures, and derived numbers are not published.